Se realiza por medio de una sonda delgada y flexible llamada endoscopio que contiene una cámara en la punta, que se introduce por la boca y esté conectado a un monitor para visualizar el interior del esófago, estómago y duodeno, el canal del endoscopio permite instrumentos para tratar distintas enfermedades como eliminación de pólipos, varices esofágicas, cuenta con la capacidad de tomar biopsias (muestras) para determinar la naturaleza de las anormalidades de las enfermedades malignas como, úlceras, tumores y cáncer gástrico o factores que lo puedan presentar en el futuro.